1、含义不同：全额拨款指所需的事业经费全部由国家预算拨款，而差额拨款是按照差额比例，由国家和单位共同承担。2、稳定性不同：比起差额拨款来说，全额拨款相对稳定；而差额拨款存在的变动可能性很大，还存在很多不确定因素。3、范围不同：实行全额拨款的主要有图书馆、文化馆、各级公办学校、党校、档案局等单位，而差额拨款的单位有医院、国有企业的行业主管局等。
全额拨款和差额拨款的区别
财政全额拨款是一种政府财政分配形式，中国主要拨款单位有图书馆、文化馆、各级公办学校、党校、档案局、文化中心、农业局下属的森防管理事业单位、动物疫病控制中心、城建局下城市维护管理的如园林处、公园、绿化站、城肥所、环卫处、疾控中心、防治站等。
差额拨款，一部分非营利性机构（如医疗卫生机构）的国家拨款方式。差额拨款单位的人员费用由国家财政拨款，其他费用自筹。人员工资构成中固定部分为60%，非固定部分为40%。
差额拨款单位的人员费用由国家财政拨款，其他费用自筹。这些单位的人员工资构成中固定部分为60%，非固定部分为40%。按照国家有关规定，差额拨款单位要根据经费自主程度，实行工资总额包干或其他符合自身特点的管理办法，促使其逐步减少国家财政拨款，向经费自收自支过渡。
