1、修建的年限不同：杭州站修建于1906年，历史悠久。杭州东站，修建于2008年。
2、车站的规模不同：杭州东站总占地面积为34万平方米，杭州站占地面积为5万余平方米。
3、每日运行的班次数量不同：杭州东站每日30条列车线路，有磁悬浮列车。杭州站每日9条列车。
4、所在的地理位置不同：杭州东站位于浙江省杭州市江干区全福桥路2号。杭州站位于浙江省杭州市上城区环城东路1号。公交和地铁线路也有所不同。
5、历史文化底蕴不同：杭州站近于清光绪三十二年，拥有近100年的历史沿革。杭州东站近期才开始投入建设。
6、线路不同：杭州站主要的线路是沪昆铁路和宣杭铁路，杭州东站在此基础上又添加了骁勇铁路，沪昆高速铁路，民航高速铁路，杭甬高速铁路，杭黄高速铁路。杭州东站到达的目的地更多，更广。
7、在购票的时候就能看到自己的出发站，在车票上也能看到自己的出发站。
