目前，采用“分型对症疗法”治疗甲沟炎收到良好效果，详情如下：
急性甲沟炎
针对不同类型病菌，施以敏感抗生素，直接杀灭病源；严重时可进行楔型切除手术，将病变指甲附近进行局部麻醉后将肉切开，以彻底剪除嵌入肉内的指甲。
慢性甲沟炎
针对不同疗程使用水性的类固醇搭配敏感抗霉菌剂、杀菌剂，治疗期一般为一至三个月。
顽固肥厚型慢性甲沟炎
以手术切除肿胀部分来加以治疗。
中医可选用清热解毒的五味消毒饮、黄连解毒汤加减治疗。如毒盛肿甚者加大青叶、皂刺等;如高热口渴可加生石膏;大便干结加大黄、玄明粉等;如剧痛难忍可加西黄丸。
