霉菌性鼻窦炎的致病菌就是霉菌本身。鼻窦霉菌感染为深部霉菌感染。据观察与研究，认为霉菌引起的鼻窦炎主要由以下原因所致：
1、鼻窦创伤：他处原发灶扩展或生活环境、工作环境不卫生，直接吸入含有霉菌的尘埃。
2、霉菌适宜于温热、潮湿的环境，鼻窦内可为霉菌的生长提供这样的环境，使之容易生存、繁殖。
3、随着抗生素的日益广泛的应用，可因过度抑杀细菌造成环境和体内正常的菌群失调，引起继发性霉菌感染。
4、造成机体抵抗力低下的各种因素均可诱发霉菌感染的发生，如糖尿病、血液病、免疫缺陷性疾病、激素大量长期使用、接受放射、化疗及免疫抑制剂治疗等等。
5、霉菌感染后引发变态反应性霉菌性鼻窦炎，亦即变态反应在霉菌性鼻窦炎的发病方面也起一定作用。
