1、遍历字符串所有子串，并存于字典中，每一个子串，在字典中寻找，如果存在，key加愁板一，否则新加入key，赋值为1。
dic={}
s='AAAA'
for i in range(len(s)):
for j in range(i+2,len(s)):
t=s[i:j]
if 案暗t in dic:
dic[t]+=1
else:
dic[t]=1
2
3、这个方法我把它叫做蠕虫。因为他是无重复统计，类似于蠕虫的运动。
获取所有字符，并统计在字符串中出现的次数。
def worm(s):
dic={}
for i in range(len(s)-3):
j=i
s1=s[i:i+2]
s2=s[i+2:]
while s2.find(s1)!=-1:
count=1
stemp=s2
while stemp.find(s1)!=-1:
count+=1
stemp=stemp[stemp.find(s1)+len(s1):]
if not(s1 in dic):
dic[s1]=count
j+=1
s1=s[i:j+2]
畜绵陕 s2=s[j+2:]
return dic
4、这是一个升级版的方法，因为它在比较之前引入了查询，避免不必要的统计
希望各位生物信息工作者可以相互交流，提出修改建议。
def worm(s):
dic={}
for i in range(len(s)-3):
j=i
s1=s[i:i+2]
if s1 in dic:
continue
s2=s[i+2:]
while s2.find(s1)!=-1:
count=1
stemp=s2
while stemp.find(s1)!=-1:
count+=1
stemp=stemp[stemp.find(s1)+len(s1):]
if not(s1 in dic):
dic[s1]=count
j+=1
s1=s[i:j+2]
s2=s[j+2:]
return dic
