1、遗传性，可见于遗传性小脑共济失调、橄榄桥小脑萎缩等疾病。
2、脑部长期供血不足如由于脑动脉粥样硬化造成小脑慢性缺血缺氧，逐渐发生小脑萎缩。
3、中毒，可以是治疗疾病的药物副作用如治疗癫痫的苯妥英钠，也可以是长期饮酒造成小脑细胞中毒损害继而萎缩。
4、脑血管疾病，小脑的出血或者梗死，当血肿或者梗死灶吸收后逐渐被胶原纤维代替引起小脑萎缩。
5、感染，病原微生物入侵脑部影响到小脑也可以造成后期的萎缩改变。
6、先天发育障碍，女性怀孕期间受到一些外界因素影响如苯、重金属、空气污染、病毒感染等使脑部发育受到影响可导致小脑萎缩。
