1、产品立项。根据要申报的产品的要求初步制定产品配方、生产工艺等，初步确定产品的主要原辅料、剂型、规格、包装。
2、样品试制。在以上准备工作完成后，就可以在车间进行生产尝试，过程中不断调整、摸索，甚至和市场等部门联合探讨，最终得出结论，确定产品的原辅料构成、比例合理，成型、外观、口感等感官要求符合预期要求。
3、中试生产。中试生产的样品将用于保健食品申报过程中的注册检验、复核检验、上会等，可以说是最终形态。因此，样品试制的时候所有工作必须全部完成。中试生产过程中需严格按照生产要求，保留生产、品控等数据，同时，这也是为后面的现场核查做准备。
4、抽样。省局按照企业提出的抽样申请进行抽样，所抽样品将用于后面的注册检验、复核检验等。产品的抽取数量一般认为是3批中试量，一定要注意满足试验所需的数量。
5、注册检验。根据产品的功能声称，确定功能试验项目，根据原料性质确定功效成分或标志性成分检测、卫生学试验、稳定性试验、毒理试验。除营养素补充剂外，一般以上试验都需要做。
6、注册受理。进入此阶段意味着，产品将拥有注册受理号。
