1、农业措施1.培育无病苗木：用种子繁殖砧木，选用无毒接穗。2.淘汰病株：未结果的感病幼树应及时刨除。3.生物防治：利用毒株系对致病强毒系干扰作用，减轻病情。
2、药剂防治 对病株及病株周围的果树在萌芽期5天左右、花露红期、谢花后7-10天、夏至后至秋分前4个时期，分别使用病毒Ⅱ号300—450倍液稀释（或者病毒1号，每40克兑水15公斤，开花前后可适当减量），同时每桶水添加纯牛奶1包，进行喷雾，可有效预防和控制苹果病毒病。 病情严重的果树，可在萌芽时期进行病毒Ⅱ号450倍液灌根，主要灌毛细根区，每株浇灌药液50-60斤水左右。
