1、传统方法
由于天然水蛭素存在于吸血水蛭唾液 、-譬腺及其所分泌的唾液中，传统提取天然水蛭素的方法通常是采用日本医蛭头部或整体进行提取天然水蛭素。其常规提取方法是：以吸血水蛭的头部为原料，因为水蛭躯体中有较大量的结构与水蛭素类似，但无生物活性的“伪水蛭素”组分存在，食的存存熔增加水蛭素分离的难度。利用水—丙酮混合剂萃取或经过乙醇分级沉淀，即得水蛭素粗制品溶液，然后采用层析法（如凝胶层析法、亲和层析法等）、等电聚焦等方法提取天然水蛭素。
2、仿生诱导法
仿生诱导法即指用仿生诱导的方法对活体水蛭进行诱导，从而得到水蛭养殖素的一种方法。它避免了传统方法对水蛭的一次性掠杀，既保护了水蛭的野生资源，又带动了水蛭养殖业的发展，为水蛭素的产业化提供了理论基础。具体方法是：将日本医蛭在充氧条件下饥饿一周，再利用猪血与螺类混合做成的诱导体系，在25℃，pH7. 2的条件下对其进行诱导30分钟，使其分泌唾液（即天然水蛭素粗品，其杂质比常规方法提取的减少手，品且不够响水蛭素的提取率），然后将唾液进一步分离纯化制得天然水蛭素。这是对天然水蛭素传统提取领域的一次革命，它既不杀死水蛭，又可后每利用，且在分离纯化过程中减少了水—丙酮的萃取或乙醇分级沉淀等工序，操作简便、方法独特，明显降低了生产成本，从而使天然水蛭素的规模化生产变为现实。
