1、ChemBioDraw笔工具主要用于绘制模板中没有的特殊箭头、轨道、基本图形等，它有两个子工具，分别是涂鸦式笔工具和连接式笔工具。
2、增加一条线段：给笔工具绘制的曲线增加线段的方法：1、选择【笔】工具，单击曲线，此时曲线端点的控制柄与端点相连，呈“改变绘制状态”；2、在需要添加线段的位置单击，此时单击处与曲线最后绘制的端点之间会添加一条线段；3、按Esc键或单击任何其他工具，结束操作。
3、删除一条线段：删除已绘制曲线中一条线段的方法：1、选择【笔】工具，单击曲线，此时曲线端点的控制柄与端点相连，呈“改变绘制状态”；2、按住Shift+Alt键并将光标放置于要删除的曲线端点上，此时光标变为空心方块（【橡皮】工具的光标），把端点罩住；3、单击端点，可消除端点后的一条线段。
