1、宽带传输速度不同。
PCI和PCIE插槽主要的区别在于宽带传输速度不同，PCI-E可以把数据传输率提高到一个很高的频率，达到PCI所不能提供的高带宽，PCI插槽传输速率相对PCI-E要低约4倍左右。
2、兼容性不同。
在兼容性方面，PCI-E在软件层面上兼容目前的PCI技术和设备，支持PCI设备和内存模组的初始化，也就是说过去的驱动程序、操作系统无需推倒重来，就可以支持PCI-E设备。目前PCI-E已经成为显卡的接口的主流。
3、插口不同
PCI Express指的是现在的最新的显卡插口，现在正是PCI Express和AGP（加速图形端口）转换的时期，以前的显卡用的都是AGP口。最早是显卡用的是PCI之后是AGP到现在的PCI Express，而后者的速度更快。
4、传输方式不同。
PCI Express和PCI不同的是实现了传输方式从并行到串行的转变。PCI Express是采用点对点的串行连接方式，支持热插拔及热交换的特性。
参考资料来源：百度百科-pci Express
