1、一般治疗：改变生活方式与饮食习惯。为了减少卧位及夜间反流可将床头抬高15～20cm。避免睡前2小时内进食，白天进餐后亦不宜立即卧床。
2、促胃肠动力药：如多潘立酮等，这类药物可能通过增加LES 压力、改善食管蠕动功能、促进胃排空，从而达到减少胃内容物食管反流及减少其在食管的暴露时间。
3、抑酸药：包括西咪替丁、奥美拉唑等。抑酸治疗是目前治疗本病的主要措施，对初次接受治疗的患者或有食管炎的患者宜以PPI治疗，以求迅速控制症状、治愈食管炎。
4、维持治疗：胃食管反流病具有慢性复发倾向，为减少症状复发，防止食管炎反复复发引起的并发症，需考虑给予维持治疗。
5、抗反流手术治疗：抗反流手术是不同术式的胃底折叠术，目的是阻止胃内容反流入食管。抗反流手术的疗效与PPI 相当，但术后有一定并发症。因此，对于那些需要长期使用大剂量PPI 维持治疗的患者，可以根据患者的意愿来决定抗反流手术。
6、并发症的治疗：食管狭窄除极少数严重瘢痕性狭窄需行手术切除外，绝大部分狭窄可行内镜下食管扩张术治疗。Barrett 食管必须使用PPI 治疗及长程维持治疗。
