一、指代不同
1、映轴：又称映转轴。是一种复合的对称要素。
2、反轴：旋转-倒反（又称旋转-反演）对称动作（或称为对称操作）对应的对称元素。
二、特点不同
1、映轴：相应的几何要素是一个假想平面与垂直此平面的一根假想直线两者的组合。当物体或图形绕此直线旋转一定的角度后,紧接着再借助于此假想平面的反映(也可以先反映再旋转),其最后结果可使各相同部分发生重复。
2、反轴：是一个复合操作，先绕一条轴旋转，继而针对轴上一点进行反演，结果复原。
三、作用不同
1、映轴：晶体中只能有1次、2次、3次、4次和6次旋转反映轴。旋转反映轴与旋转反伸轴之间存在着对应的等效关系。
2、反轴：进行旋转时需以反轴轴线为依据，其后继之以进行倒反时又需以反轴轴线上一个不动点为依据，所以反轴是一类点线结合的对称元素。
参考资料来源：百度百科-旋转反映轴
参考资料来源：百度百科- 反轴
